本學程除規劃「跨領域科學基礎課程」及「跨領域科學核心課程」外，為培養同學之研究能力，由本院教師特別開設「基礎科學研究方法」及「跨領域科學專題」課程（請自行下載 專題指導同意書），以身教與言教同時並進，以引導學生對研究之興趣與能力。每年寒暑假時，本學程學生可以向理學院申請補助(理學院科學築夢計畫)，參加理學院或國內外著名研究單位主辦之短期課程或參與教授之個別研究及實驗。本學程學生在學期間， 將選定兩位不同專長之本院教授為其導師，對其生活、課業及生涯規劃進行個別輔導，拉近日益疏遠的師生關係。本學程將有專屬的活動空間(跨領域科學教室SC104)以加強本班學生之內部聯繫。本學程學生完成主修學系或原學系之修業規定者，授予該系學士學位，同時完成本班之修業規定， 依規定授予主修學系或原學系及「科學學士學位學程」之雙學位。本學程學生表現優異者，得申請逕修博士班或輔導出國攻讀博士學位。